女性的外生殖器不仅前面与尿道口吡邻，后面与肛门邻近，这对于阴道的卫生显然不利；而且外阴及阴道又是性交、分娩的场所，是女性内生殖器官与外界相通的开口，因此容易受到损伤和外界致病因素的侵扰。但是由于女性外阴及生殖道在解剖和生理功能特点上有其形成的比较完善的自然防御功能，所以在正常情况下并不会因有少量病原体的侵犯就引起女性生殖器官感染。这种自然防御功能表现在如下几个方面：

(1) 女性外阴的大、小阴唇相互合拢，像两道门一样将阴道口、尿道口遮掩起来，以阻止病菌进入阴道和尿道；

(2) 女性骨盆底有许多肌肉组织。由于盆底肌的作用，使阴道口平时处于闭合状态，阴道前后壁紧紧相贴，使管腔闭合，从而防止外界污染物的侵入。但对经产妇而言，阴道壁比较松驰，这种防御功能会有所减弱；

(3) 输卵管的蠕动和收缩，再加上输卵管内层上皮细胞纤毛向子宫方向的摆动，不仅有助于运送卵子，而且会对入侵输卵管的致病菌起到清除作用，防止炎症向上蔓延。

(4) 阴道自净作用：阴道内并非是无菌的，而是存在着许多不同种类的细菌，但是通常不会引起疾病，这是因为在正常情况下卵巢分泌的雌激素能促使阴道上皮细胞增生变厚，增加了对病原体的抵抗力，另外，阴道上皮细胞内含有丰富的糖原，在正常妇女的阴道中寄生着的大量阴道杆菌的作用下，把这些糖原分解成乳酸，使阴道内保持正常的酸性环境，pH值保持在4.5以下，使那些宜于在碱性环境中生长的病原体因此会受到抑制，这就是阴道的自净作用。　

(5) 在卵巢分泌的性激素的作用下，一方面使子宫内膜发生周期性的脱落，产生月经，使侵入宫腔的病原体随着子宫内膜的排出得到清除；同时子宫内新内膜的长出也不利于病原菌的繁殖和扎根。另一方面，子宫颈粘膜腺体分泌的粘液形成粘液栓，堵塞宫颈管，将子宫颈管与外界环境隔离开，对防止细菌上行感染有重要作用。另外，宫颈内口平时也处于闭合状态，同样可以阻止病原体的入侵。

          (6) 机体的免疫屏障作用：当病原微生物从皮肤或黏膜侵入机体后，可引起机体的免疫反应，一是白细胞逸出血管外，聚集在病原微生物周围吞噬病原体；另一是受到侵袭的组织产生自身抗体，对局部感染具有特异的防御作用。系统免疫功能的强弱与身体的状况有很大关系。